序辨初生脉证并治第一辨寒热脉证并治第二辨发惊脉证并治第三辨疮疹脉症并治第四辨疳病脉证并治第五辨上焦病脉证并治第六辨中焦病脉证并治第七辨下焦病脉证并治第八附录护养
序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
简介杂病·自叙杂病·卷第一 诸中门·诸伤门·寒热门杂病·卷第二 诸气门杂病·卷第三 诸呕逆门·诸血门杂病·卷第四 诸痛门·痿痹门杂病·卷第五 诸风门·神志门·杂门杂病·卷第六 大小腑门杂病·卷第七 七
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
马序王序一夏序王序二曹序许序陶序秦序丁甘仁先生别传卷一伤寒案风温案暑温案湿温案痉症案卷二霍乱案泄泻案痢疾案疟疾案喉痧案附∶白喉案附∶痧后案卷三中风案类中案神志案内伤杂病案附∶不寐案附∶肝气肝阳案附∶头
序卷一月经门经论女子月事属太冲脉盛经论女子血海属于少阴一经经论女子经水温寒与天地相应女子月事本血室以时而下论女子月经本任冲二脉血海有余论女子月事本任督二脉血海之满论妇人月水本于四经论女子天癸之至名月信
难经经释
卷一痘原出痘形证痘出五脏形证痘主部位痘形顺逆痘色顺逆痘证老嫩痘证疏密辨形神声气饮食之虚实辨气血虚实证辨表证虚实辨里证虚实辨阳热证辨阴寒证辨虚实寒热误治禀赋顺逆险天时顺逆险人事顺逆险发热顺证发热险证发热
卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
自序卷之一痈疽之源（一）痈疽之别（二）脉法（三）分经络（四）善恶（五）虚实（六）内消（七）内托（八）灸（九）针烙（十）砭镰（十一）敷贴(十二）淋洗（十三）将护（十四）禁忌（十五）肿疡(十六)发表辛凉解