叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
简介序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十附录
叶序陈序自序卷一脏腑经络先后病脉证第一卷二痉湿病脉证第二卷三百合狐惑阴阳毒病证治第三卷四疟病脉证并治第四卷四疟疾总论卷五中风历节病脉证治第五卷六血痹虚劳病脉证治第六卷七肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷八
黄帝素问灵枢叙自序卷一 刺法九针十二原一小针解二九针论三官针四终始五官能六卷二 刺法刺节真邪七逆顺八行针九血络论十论勇十一论痛十二五邪十三五乱十四五禁十五玉版十六师传十七外揣十八禁服十九卷三 经络经脉
卷上第一问 精血以分男女之本源第二问 古法男子三十而娶女子二十而嫁第三问 妇人感病倍于男子第四问 何以谓之天癸第五问 何以谓之经候第六问 经候或前或后多寡不定第七问 月水根据时来不快利第八问 经水欲行
内外伤寒辩惑论
简介凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六卷十七
自叙卷上脾胃伤风中寒暑热暑厥中伏暑注夏湿燥火症风湿风温湿温瘾疹痛风劳倦痰火咳嗽喘青筋气怒中恶伤食卷下伤酒黄胆积聚瘕僻痞块癫狂痫症三消霍乱疟疾痢疾泄泻疝气香港脚痿症
伤寒医鉴论脉证论六经传受论汗下论阳厥极深论湿热发黄论不得眠论呕吐论湿热下利论霍乱论好用寒药论小儿疮疹
杂症会心录